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疫情形势与以往不同，我国防控取得了好的效果
在2020年，根据早期武汉疫情的特征和2009年的H1N1以及2003年的SARS做了一次很好的比较。然后就发现2019年这一波疫情(COVID-19)和以前是截然不同的，而且它的传播率是远远超过2009的H1N1和2003年的SARS。
在早期防控阶段，中国总结了非常好的经验。第一就是最大化的检测。第二是对感染者进行最大化的追踪，把密接者进行很好的追踪和隔离。第三就是“应收尽收”，把所有的病人都收入医院或者方舱进行治疗。这样的方案在早期疫情来临的时候效果是非常好的。上海早期疫情的精准防控基本上都是采取了这三种模式。
奥密克戎的挑战
情况一直在变化，这个变化就是我们最近面临的最大的一个挑战：奥密克戎。奥密克戎有一个基本的繁殖数(R0)，也就是说一个人可以传染9.5个人。原则上来讲它传播的速度已经非常快，它的传播速度在已有的传染病中已经超过水痘。所以它的传播是很难控制的，这也使得最近全国各地为了能够达到动态清零的目标，都扩大了检测和追踪的规模，甚至采取区域性的静默来终止疾病的流行。
曾经通过非药物性的干预措施(NPI)都可以非常好的达到清零，但是当R0值等于9.5时，这一波疫情在全球基本上就已经控制不住了。所以当南非出现奥密克戎的时候，全球基本上都认为这是一波非常难控制的疫情。我们可以看到下图中最高的波峰是来自于南非的。后来奥密克戎就以摧枯拉朽之势席卷全球。
其他国家因为采取非药物干预措施的力度不够，都在这波疫情中没能幸免，而且感染率不可能在短期内达到一个很低的水平。
有人认为奥密克戎已经演变成为一个新的病毒。事实上从基因组学上来看，这一波上海的奥密克戎还是属于奥密克戎BA2.2这一株，还没有跨越出来。将来有可能会有BA3、BA4、BA5，关键就是看病毒的变异得会不会产生比现在传播更快、更难防控的病毒。目前上海这一波疫情还是BA2.2，我们已经做了非常精细的测序。
在奥密克戎的挑战中，我们都感觉到了前所未有的挑战。
奥密克戎特征出现重要偏移与演化
上海在这波奥密克戎的袭击中，接受了中国抗疫以来最大规模的一次挑战。现在的感染人数超过了60万，最近我们对感染者所有的症状不断地进行估算，来明确奥密克戎在症状方面的主要特征。在这之前国际上也曾经有过大规模奥密克戎的演变，对于它在临床症状上的偏移与演化，也有过非常好的报道。
在Lancet上面发表的ZOE COVID-19 Study已经证实了奥密克戎与德尔塔比较，德尔塔中非常常见的一些症状，比如说重症中比较严重的头痛、发热，或者是严重的全身性炎症，这些在奥密克戎中严重性要低一点。但是上呼吸道方面的症状显著高于德尔塔的表现，比如喉咙痛、声音嘶哑，还有一些不常见的肌肉痛。也就是说奥密克戎的症状确实有所减轻，但是上呼吸道的一些症状出现了显著的增加趋势。这个现象在上海也是类似。
抗体逃逸
在感染者中大多数人是打过疫苗的，目前除了老年人打过疫苗的比例比较低以外，其他很多数人其实都注射过疫苗，甚至接种加强针疫苗的比例也是比较高的。在这种情况下，奥密克戎出现症状的减轻有两方面的因素，一是因为注射过疫苗，二是奥密克戎的毒力也有所降低。
最近我们复旦大学的团队一起在Cell host and microbes上面发表了论文。我们发现SARS-COV-2 Omicron无论是BA.1、BA.2还是BA.3，病毒与现在我们已有的抗体血清中和的效价已经出现了大幅度的降低。也就是说它确实对我们已有的抗体具有一定的逃逸作用。而且对于感染者的恢复期血清也具有抗体的逃逸作用，这就意味着奥密克戎的中和效价因为病毒的变异而出现了一定程度的逃逸，这会使得我们已有的抗体治疗和疫苗都会发生大幅效果的降低。
脆弱人群是奥密克戎暴发以来的最大挑战
最近我们对奥密克戎和流感进行了一个深层次的比较。和西湖大学一起合作发表了相关论文。比较了炎症通路以及炎症的强度，发现了奥密克戎引起的对宿主的炎症应答确实比流感要轻一点，但是它的炎症反应在脆弱人群中还是比较严重的。也就意味着奥密克戎会诱发一定程度的炎症反应，但是程度要弱于流感。如果病人年龄比较大，而且基础疾病比较重，这种炎症反应有可能就是致死性的。
